Dans sa célèbre Introduction à l'étude de la médecine expérimentale, Claude Bernard laissait déjà entrevoir l'importance de l'élaboration d'une méthode de recherche et d'investigation en médecine. Cet ouvrage primordial ne fut découvert et publié qu'après sa mort. En réalité, il est constitué d'une suite de notes développées et rédigées entre 1862 et 1877, avec des indications suffisamment précises pour que celles-ci puissent être organisées et éditées en livre. Ces Principes font partie des lectures indispensables de l'honnête homme de culture scientifique. "Le rôle du physiologiste, comme celui de tout savant, est de chercher la vérité pour elle-même sans vouloir la faire servir de contrôle à tel ou tel système de philosophie. Dans ce cas, le meilleur système philosophique consiste à n'en pas avoir."