Il est organisé autour des 4 thèmes du programme :
> Matière, mouvement, énergie et information
> Le vivant, sa diversité et les fonctions qui le caractérisent
> Les objets techniques au cœur de la société
> La Terre, une planète peuplée par des êtres vivants

Pour impliquer et motiver les élèves, les 19 séances partent toutes d'une situation problème à mener en classe, par exemple :
Comment trier facilement les déchets ?
Quelle énergie pour s'éclairer ?
Comment adapter notre alimentation à nos besoins ?
Quel est le cycle de vie du ver de farine ?
Qu'est-ce qu'une fleur et quel est son devenir ?
Comment fonctionne la transmission d'un vélo ?
Programmer un robot ? Facile !
+ 4 dossiers interdisciplinaires pour lier les mathématiques, la géographie, l'histoire aux sciences.

Les 19 séances du cahier proposent :
Une situation problème à résoudre
Des documents à lire et observer
Des schémas ou images à légender ou à compléter
Des espaces pour rendre compte des expériences menées en classe : noter ses hypothèses, dessiner l'expérience réalisée et garder trace des observations et conclusions
Des activités pour approfondir la notion
Une rubrique " Mots à apprendre "
Un espace pour noter la synthèse finale : " Ce que nous avons appris "
Pour mener les séances en classe, le Guide pédagogique + ressources numériques propose pour chaque séance :
une rubrique " L'essentiel à savoir pour l'enseignant " pour réactiver ses connaissances ;
un descriptif détaillé du déroulement pédagogique, étape par étape : les questions à poser, les réponses attendues, les savoirs à transmettre, la synthèse de la séance ;
des évaluations ;
des vidéos, animations, fiches complémentaires, posters à vidéoprojeter ou imprimer.
La version numérique du cahier (bientôt disponible) sera accessible gratuitement pour les enseignants adoptants ; elle permettra de vidéoprojeter les documents et activités et contiendra tous les corrigés.