L'aire marine protégée (AMP) de Saint-Louis, située entre l'ancienne embouchure du fleuve Sénégal (avant 2003) et le quartier pêcheur de Guet-Ndar (Saint-Louis) est la plus vaste des 5 AMP créées au Sénégal en 2004. Sa biodiversité, étudiée en croisant diverses sources de données (campagnes scientifiques, enquêtes de terrain, état de référence, etc.), révèle 437 espèces halieutiques et 83 espèces aviaires dont la viabilité est confrontée à des menaces d'ordre naturel, anthropique, institutionnel et politique. Cet inventaire, le premier du genre pour l'AMP de St-Louis de par le nombre de sources de données (5 au total) est, toutefois, à approfondir pour les taxons mal renseignés tels que les cétacés. Des pré-requis sont précisés, suivis de la proposition de 8 indicateurs de bonne gouvernance et de suivi de la biodiversité afin que l'AMP réponde aux attentes placées en elle lors de sa création.